●現在設定（原作に沿った設定）＆未来設定（成長パロ）共通設定
・所在地は兵庫ということにしてある（キャラのネーミングなどから）
・時間軸が現在のため、学園自体の性質が「忍術も学べる、中高大一貫の大規模な学校」となっている。実は大学院もあるんだぜ…
・↑故全員原作＋３歳。原作の１～６年は中学＆高校に相当、その後は上級忍術専攻コース（こちらは大学に相当）に進学
・施設諸々は雰囲気を損なわない程度に近代化済み
・NARUTO的世界観も混じっている故、チャクラを使用する忍術（影分身・変化は日常茶飯事）や、危険を伴う任務なども存在。城も戦国時代から引き続き存在する（戦闘は亜空間で行われるため、一般人に危害は及ばない）
・↑に加え普通にポケモンも生息している
・学内恋愛が大々的に横行。ＮＬもＢＬもＧＬもお構いなしの色恋模様
・↑の事情＋予算補給のため保健・図書・作法・用具の４委員会が手を組んでナイトライフ商品を販売（各企業とも提携して学園のプライベートブランドとして展開。警視庁も一応認可している）、学園の副業となっている。通販は会計が担当。因みに現６年生達が入学する前から開業しているｗｗ
・長屋の部屋割りが変わっている＋「委員長室」新設
・全員何かしらの免許や資格を有している（危険物取り扱いとか銃火器免許・刀剣免許とか）

●未来設定のみの設定
・現１年が６年に
・ユキ達くのいち生徒＆２～５年は大学生（上級忍術専攻）、６年は卒業後教師として就任（在学中に教員免許を取得）
　６い＝１い担当、仙蔵が教科、文次郎が実技
　６ろ＝１ろ担当、長次が教科、小平太が実技
　６は＝１は担当、伊作が教科、留三郎が実技

●改築後の忍たま長屋と部屋割りの変更
・１号棟…進学した上級生軍団＆教師となった元６年生軍団の部屋がある。
１０１：三郎次、左近、久作、四郎兵衛
１０２：孫兵、左門、三之助
１０３：作兵衛、藤内、数馬
１０４：滝夜叉丸、三木ヱ門、喜八郎、タカ丸
１０５：雷蔵、勘右衛門、三郎（実況用モニター他色々仕掛けてあり、放送室の役割も兼ねている）
１０６：兵助、八左ヱ門、文次郎、小平太（↓と二間続き）
１０７：長次、留三郎、仙蔵、伊作（↑と二間続き）
１０８：友一、亮、雨月、兵士（佳奈美様宅の子はここで一緒に暮らしており、雨月は３人のペット的存在）
・２号棟…未来１年生一同はここに部屋が割り当てられている。
２０１：優、玲次、陽大
２０２：竜馬、良一、博希（山麓丸＆青葉は飼育小屋ではなくこの部屋で飼われている）
２０３：源堂、浩介、吉彦、響
２０４：武、隼人、漂太
２０５：涼、一輝、健
２０６：恭二、拓人、文則
２０７：純也、小五郎、基弘
２０８：幸彦、隆二、康孝
２０９：洋太、薫、彰
・３号棟…未来上級生一同はここに部屋が割り当てられている。
３０１：港輝、創、実、明彦
３０２：小麦、八郎、司
３０３：学、麗、舞人
３０４：陽助、金桜、雪光、新
３０５：深愛、竹熊、萌芽
３０６：明神、小鉄、海雄
・４号棟…成長６年生軍団＆くのいち生徒の部屋がある。主役４人はここに部屋を構える。
４０１：圭介、乱太郎、きり丸、しんべヱ（全員彼女持ちなので通称「リア充部屋」（笑））
４０２：庄左ヱ門、伊助、虎若、団蔵
４０３：三治郎、金吾、兵太夫、喜三太（地下に大規模なカラクリ部屋がある）
４０４：伝七、左吉、平太、怪士丸
４０５：彦四郎、一平、伏木蔵、孫次郎
４０６：ユキ、トモミ、シゲ、シオリ
４０７：ソウコ、ミカ、アヤカ、ナオミ
４０８：レイナ、ミミ、美希
・教員棟…先生方の部屋がある。
ここには特に部屋番号は設定されておらず、１号棟に一番近い部屋が新平と雛の部屋。
その向かいに郁美の部屋があり、時々殺蔵の姿もそこにある（笑）。隣に一左ヱ門の部屋があり、佳音はそこで暮らしている
・委員長室…離れみたいな感じで、別棟で造られている。部屋３～４室分程度の広さがあり、頑丈な造り。
災害時などに備えて布団もある。予算会議や委員長会議はここで行われる